Le gène du cancer du poumon chez les non-fumeurs trouvé

« Les personnes qui contractent un cancer du poumon et qui n’ont jamais fumé semblent avoir une variation génétique en commun qui les prédispose à la maladie », a rapporté le Times. Il a déclaré que les chercheurs ont découvert qu’un gène appelé GPC5 est plus commun chez les non-fumeurs atteints de cancer du poumon que chez les non-fumeurs sans la maladie.

Le reportage rapporte une étude d’association pangénomique qui a trouvé une association entre un variant de gène particulier (sur le chromosome 13q31.3) et le fonctionnement d’un gène appelé GPC5. Une expression réduite (activité) de ce gène semble contribuer au développement du cancer du poumon chez les personnes qui n’ont jamais fumé.

Cette étude bien menée nous permet de mieux comprendre pourquoi les personnes qui ne fument jamais peuvent développer un cancer du poumon. Il présente certaines insuffisances, comme la petite taille des échantillons (en raison de la difficulté de trouver suffisamment de personnes atteintes d’un cancer du poumon qui n’ont jamais fumé), mais c’est un bon point de départ pour la recherche dans ce domaine. Programmes de dépistage ou de médicaments pour prévenir ou traiter la maladie sur la base de ces résultats sont encore loin. Le tabagisme reste le facteur de risque le plus important connu pour le cancer du poumon, causant 90% de tous les cas.

D’où vient l’histoire?

La recherche a été dirigée par le Dr Xifeng Wu du MD Anderson Cancer Center de l’Université du Texas et le Dr Ping Yang du Mayo Clinic College of Medicine, avec des collègues d’autres institutions universitaires et médicales des États-Unis. La recherche a été financée par les National Institutes of Health des États-Unis et la Fondation Mayo ainsi que le financement de chercheurs individuels. Le document de recherche a été publié dans la revue médicale revue par les pairs The Lancet.

Il s’agissait d’une recherche génétique bien menée qui visait à reproduire ses résultats initiaux auprès d’une population de plusieurs populations différentes. Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêt.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Il s’agissait d’une étude d’association pangénomique d’une population initiale de 754 personnes n’ayant jamais fumé ou n’ayant jamais fumé, de 377 personnes atteintes d’un cancer du poumon et de 377 témoins sains appariés. Les chercheurs ont examiné l’ADN de ces individus pour des variants (paires de nucléotides simples ou SNP) plus ou moins communs dans les cas et qui pourraient donc être associés au risque de cancer du poumon. Une analyse plus approfondie a été effectuée sur les variants les plus fortement associés à la maladie.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Les études d’association à l’échelle du génome examinent la fréquence à laquelle des variantes d’ADN particulières se produisent chez les personnes atteintes d’une maladie, comparativement à la fréquence à laquelle elles surviennent chez les personnes sans maladie. Ils constituent une forme d’étude cas-témoins. Cette étude a examiné si des variantes génétiques particulières étaient associées au cancer du poumon chez les personnes qui n’ont jamais fumé. Il est bien connu que le tabagisme est le plus grand facteur de risque de cancer du poumon et neuf cas sur dix sont causés par le tabagisme. Cependant, certaines personnes qui ne fument jamais attrapent la maladie.

Les chercheurs ont d’abord analysé l’ADN d’une population de 377 personnes jamais atteintes du cancer du poumon et de 377 adultes en bonne santé, dont l’âge, le sexe et l’origine ethnique étaient identiques. Les fumeurs n’ont jamais été définis comme des personnes ayant fumé moins de 100 cigarettes au cours de leur vie.

Cette analyse a abouti à 44 paires de nucléotides uniques (SNP) «top» associées au cancer du poumon. Ces SNP ont été évalués plus en répliquant les analyses d’ADN dans deux autres échantillons indépendants, le premier consistant en 328 cas de cancer du poumon et 407 contrôles, et le second de 92 cas et 161 contrôles. Les deux SNP supérieurs (c’est-à-dire les variants les plus associés à la maladie) provenant de ces deux échantillons ont été en outre répliqués dans un autre échantillon indépendant de 91 cas et de 439 témoins.

Dans leur analyse visant à déterminer dans quelle mesure les variantes génétiques étaient associées au risque de maladie, les chercheurs ont tenu compte de certains facteurs pouvant influencer le risque (facteurs de confusion). Ceux-ci incluaient l’exposition à la fumée secondaire à l’âge adulte, à l’enfance ou au cours de la vie; antécédents familiaux de cancer du poumon et d’autres cancers; et l’apparition d’une maladie pulmonaire obstructive chronique.

Une analyse séparée a examiné les gènes qui étaient à proximité des SNP qui avaient été identifiés. Cela a permis aux chercheurs de déterminer si les SNP avaient un effet fonctionnel, par exemple s’ils réduisaient ou augmentaient l’expression de certains gènes.

Quels ont été les résultats de base?

La première analyse a révélé 44 SNP supérieurs qui pourraient modifier le risque de cancer du poumon chez les personnes qui ne fument jamais. Un SNP particulier était associé à la maladie dans quatre échantillons indépendants. L’analyse a montré que la présence de cette variante augmentait significativement le risque d’un cancer du poumon n’ayant jamais fumé de 1,46 fois (odds ratio 1,46, intervalle de confiance à 95% 1,26 à 1,70).

Une analyse plus poussée a montré un fort lien inverse entre cette variante et les niveaux d’un gène appelé GPC5, qui se produit dans le tissu pulmonaire normal. Cela signifie que la présence du variant était associée à des niveaux plus bas de l’activité du gène. D’autres expériences ont indiqué qu’il y avait deux fois la concentration de GPC5 dans le tissu pulmonaire normal que dans le tissu des poumons atteints d’adénocarcinome (un type de cancer du poumon).

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs disent que les variants génétiques dans une région particulière (rs2352028) sur le chromosome 13q31.3, dans un gène appelé GPC5, ont modifié l’expression de ce gène chez les personnes qui n’avaient jamais fumé et augmenté leur susceptibilité au cancer du poumon.

Conclusion

Cette étude a rapporté une recherche scientifique fiable et intéressera la communauté de la recherche génétique. L’étude a identifié une variante de la séquence d’ADN liée à l’expression d’un gène particulier et qui affecte le risque de cancer du poumon chez les personnes qui n’ont jamais fumé.

En excluant le tabagisme, le plus grand facteur de risque de cancer du poumon, les chercheurs ont accru notre compréhension du lien complexe entre la génétique et le cancer du poumon. Ils ont encore renforcé leur étude en tentant de prendre en compte l’exposition des participants à la fumée secondaire, bien qu’il soit difficile de quantifier avec précision cette exposition.

Certains facteurs importants doivent être pris en compte lors de l’interprétation des résultats de cette étude. Les chercheurs reconnaissent avoir des difficultés à recruter des «purs» jamais fumeurs, et en particulier des personnes atteintes d’un cancer du poumon qui n’ont jamais fumé, étant donné que 90% de tous les cancers du poumon sont causés par le tabagisme. Cela a donné lieu à un petit échantillon de personnes à analyser. Bien que les chercheurs aient réussi à identifier de nouvelles variantes génétiques associées au cancer du poumon, ils disent que la petite taille peut avoir signifié un «manque de puissance» pour détecter d’autres associations significatives. De plus, ils disent ne pas être en mesure de s’adapter complètement aux facteurs de confusion, car certaines des études analysées ne disposaient pas de données complètes pour rendre cela possible.

La génétique du cancer du poumon est susceptible d’être complexe, et d’autres études sont nécessaires pour déterminer s’il existe d’autres associations et comment la génétique et l’environnement interagissent et contribuent au risque. Plus d’informations sont nécessaires avant que les programmes de dépistage génétique de la susceptibilité au cancer du poumon deviennent une réalité.

Le tabagisme reste le facteur de risque le plus important connu pour le cancer du poumon, et l’arrêt du tabac est le meilleur moyen de réduire les risques.

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