Résistance à la fluoroquinolone de faible niveau chez les isolats de Campylobacter jejuni en Australie

Contexte Des isolats de Campylobacter jejuni résistant à la ciprofloxacine obtenus à partir de patients infectés en Australie n’ont pas été détectés dans des études d’isolats provenant de zones géographiques spécifiques. Le gouvernement australien a interdit l’utilisation de fluoroquinolone chez les animaux producteurs d’aliments. Nous avons mené une étude de la prévalence des isolats de C jejuni sur des agents antimicrobiens. Des isolats de C jejuni prélevés sur des patients des États australiens du Queensland, d’Australie méridionale, de Tasmanie, de Victoria et d’Australie occidentale ont été identifiés. Résultats Parmi les infections acquises localement, seulement% des isolats varient,% -% dans différents états étaient résistants à la ciprofloxacine Les isolats acquis localement présentaient également une résistance au sulfisoxazole%, à l’ampicilline%, à la roxithromyc en%, tétracycline%, acide nalidixique%, chloramphénicol%, érythromycine%, gentamicine% et kanamycine% Le traitement avec des agents antimicrobiens dans les semaines précédant l’apparition n’était pas associé à la résistance à la ciprofloxacineConclusions Le très faible niveau de résistance à la ciprofloxacine dans les isolats de C jejuni reflète probablement le succès de la politique australienne de restriction de l’utilisation des fluoroquinolones chez les animaux producteurs d’aliments

Les espèces de Campylobacter sont la cause bactérienne la plus commune des maladies d’origine alimentaire en Australie et dans d’autres pays industrialisés et constituent une charge substantielle pour la santé. L’incidence des cas déclarés en Australie est de [En] En Europe et aux États-Unis, des proportions croissantes de patients sont infectés par des souches de Campylobacter présentant une résistance aux antimicrobiens, en particulier la résistance aux fluoroquinolones La résistance aux antimicrobiens peut ajouter au fardeau de la maladie; les organismes résistants aux fluoroquinolones ont été associés à une maladie plus sévère , y compris une diarrhée de plus longue durée et une probabilité accrue de maladie invasive et de décès L’incidence croissante de la résistance aux fluoroquinolones a été attribuée à fluoroquinolones chez les animaux producteurs d’aliments et reflète la forte prévalence d’isolats de Campylobacter animaux résistants à la ciprofloxacine chez les animaux dans ces pays La surveillance de la résistance aux antimicrobiens est importante pour surveiller les tendances Les données concernant la résistance aux antimicrobiens parmi les isolats de Campylobacter en Australie sont limitées et les études ont été limitées à des régions géographiques spécifiques Les isolats résistants ne sont pas communs, et la résistance aux fluoroquinolones n’a pas été détectée auparavant parmi les isolats obtenus localement Le but de cette étude était d’estimer la prévalence de la résistance antimicrobienne parmi les isolats australiens de Campylobacter jejuni L’Australie est dans une presque En mesurant la prévalence de la résistance aux fluoroquinolones parmi les isolats de C jejuni obtenus de patients australiens, il est possible d’utiliser des fluoroquinolones chez des animaux producteurs d’aliments, même si leur production est comparable à celle d’autres pays développés. Les chercheurs ont examiné la prévalence de la résistance aux isolats de Campylobacter obtenus auprès de patients provenant de juridictions, représentant ~% de la population australienne, sur une période de comparé selon le statut de voyage et la juridiction

Méthodes

Les isolats de mpylobacter ont été recueillis chez des patients inscrits dans une étude multicentrique, prospective et cas-témoins d’infections sporadiques à déclarer séparément. Les cas-patients ont été identifiés à partir de rapports de laboratoire des états australiens Queensland, Australie du Sud, Tasmanie, Victoria et Australie occidentale entre septembre et août Ces juridictions représentaient tous les États exigeant des médecins et des laboratoires qu’ils signalent les patients infectés par des Campylobacter. Les territoires australiens n’étaient pas inclus et la Nouvelle-Galles du Sud, où Campylobacter n’est pas à déclaration obligatoire, était exclue. Les patients étaient exclus s’ils ne pouvaient pas être contactés, leurs parents n’étaient pas anglophones, ils ne pouvaient pas répondre aux questions, par exemple, à cause de la démence ou parce qu’ils étaient décédés, ils ne pouvaient pas se souvenir de la date d’apparition. leur diarrhée, l’apparition a été ⩾ jours avant que le spécimen a été recueilli, ils n’ont pas pu être interrogés dans les jours qui ont suivi leur apparition, un autre membre du ménage avait eu la diarrhée ou avait reçu un diagnostic d’infection à Campylobacter au cours des semaines précédentes, ils avaient une infection mixte, un agent pathogène diarrhéique supplémentaire était détecté simultanément, ils faisaient partie d’une Un questionnaire téléphonique a été utilisé pour documenter les expositions pour les jours précédant l’apparition de la maladie. Les questions incluaient des détails sur le pays de voyage et les dates de voyage, les caractéristiques démographiques, l’âge et le sexe, la sévérité de la diarrhée, les selles sanglantes, Fièvre et vomissements, prise en charge hospitalière hospitalisation et durée d’hospitalisation, consommation d’agents antimicrobiens dans les semaines précédant l’apparition et maladies sous-jacentes méthodes de laboratoire Les isolats de Campylobacter ont été transportés du laboratoire clinique au laboratoire public de santé publique pour stockage et analyses supplémentaires. isolats ont été distingués de non -jejuni dans chaque laboratoire de santé publique utilisant la PCR ciblant le gène HipO , et seuls les isolats de C jejuni sous-espèce jejuni ou doylei ont été inclus dans l’étudeDes tests de sensibilité ont été effectués dans chaque laboratoire de santé publique par la méthode de dilution en gélose à l’agar Mueller-Hinton comme décrit ailleurs Les CMI ont été définies comme la concentration la plus faible donnant une inhibition complète de la croissance visible. Agents antimicrobiens testés et points de rupture indiquant la résistance était la suivante: acide nalidixique, ⩾ mg / L; ciprofloxacine, ⩾ mg / L; tétracycline, ⩾ mg / L; ampicilline, ⩾ mg / L; érythromycine, ⩾ mg / l; la roxithromycine, ⩾ mg / L; gentamicine, ⩾ mg / l; la kanamycine, ⩾ mg / L; chloramphenicol, ⩾ mg / L; et sulfisoxazole, ⩾ mg / L Étant donné qu’il n’y a pas de seuils recommandés pour les espèces de Campylobacter, les seuils CLSI pour les Enterobacteriaceae ont été utilisés, à l’exception de l’érythromycine pour laquelle le seuil de Staphylococcus a été utilisé . ont été testés pour la sensibilité aux agents utilisés dans l’étude ont été testés par chaque laboratoire pour garantir la reproductibilité des résultats. Pendant le test des isolats de l’étude, le même isolat de C jejuni NCTC que l’ATCC recommandé par le CLSI a été inclus. contrôle dans chaque lot de test. Analyses statistiques Nous avons comparé les patients suivants: patients infectés par des isolats résistants à la ciprofloxacine et patients infectés par des isolats sensibles; la prévalence de la résistance parmi les isolats acquis localement et la prévalence parmi les isolats acquis à l’étranger; et la sévérité de la maladie chez les patients infectés par Campylobacter sensible à la ciprofloxacine et la sévérité de la maladie chez les patients infectés par Campylobacter résistant à la ciprofloxacine Les indicateurs de gravité suivants ont été examinés: durée de la diarrhée, présence de sang dans les selles, fièvre et vomissements, hospitalisation, et la durée de l’hospitalisation Les CI pour la prévalence et les OR étaient basés sur de grandes méthodes standard d’échantillonnage pour estimer les proportions. Les méthodes exactes étaient utilisées lorsque les comptages étaient petits. En particulier, le test exact de Fisher a été utilisé pour comparer la prévalence de la résistance aux antimicrobiens. avec la prévalence de la résistance chez les isolats acquis en voyage Les prévalences de résistance parmi les isolats d’infections contractées localement ont été comparées entre les juridictions et par statut d’exposition aux antimicrobiens en utilisant des tests de vraisemblance basés sur la régression logistique, avec des variables confondantes incluses dans les analyses. sont des mesures dichotomiques de la gravité de la maladie, comme l’hospitalisation et le sang dans les selles, alors que la régression linéaire standard a été utilisée pour comparer les mesures continues telles que la durée de la maladie et la durée du séjour hospitalier.

Résultats

Les caractéristiques de la population étudiée, y compris le nombre de cas d’infection à Campylobacter signalés au cours de la période d’étude, le nombre de cas-patients recrutés et la proportion d’isolats testés, sont résumés par l’état dans le tableau. La proportion d’isolats de Campylobacter testés pour la sensibilité aux antimicrobiens des cas-patients déclarés dans chaque état variait de% à Victoria à% en Australie-Méridionale. La population sous surveillance dans les États participants comprenait ~ % de la population australienne

Vue de la table grandTélécharger la diapositiveRésumé des patients atteints d’une infection à Campylobacter et des isolats de Campylobacter jejuni inclus dans l’étudeTableau de vue largeTélécharger le résumé des patients infectés par Campylobacter et des isolats de Campylobacter jejuni inclus dans l’étudePrévalences de résistance aux agents antimicrobiens parmi les isolats acquis localement est présenté dans le tableau Sulfisoxazole la résistance était le pourcentage le plus commun d’isolats, et seulement% des isolats étaient résistants à la ciprofloxacine

DiapositiveDétecteur d’isolats de Campylobacter jejuni acquis localement et résistants aux agents antimicrobiens selon l’état, septembre -August Table View largeDownload slidePourcentage d’isolats de Campylobacter jejuni acquis localement et résistants aux agents antimicrobiens selon l’état, Septembre-La résistance à la Ciprofloxacine a été observée parmi les isolats acquis localement. Etats sauf tableau de Tasmanie Tous les isolats acquis localement étaient également résistants à l’acide nalidixique, et% étaient résistants à & gt; classe de tableau des agents antimicrobiens Des grappes temporelles d’infection ont été détectées à Victoria en novembre-décembre et janvier-février et en Australie-Méridionale en mai, mais une variété de phénotypes de résistance ont été détectés dans ces groupes, indiquant que les isolats de la résistance à la ciprofloxacine à Victoria était plus élevée que dans tous les autres états combinés% vs%; OU, ; % CI, -, mais cette différence significative doit être interprétée avec prudence, car il s’agit d’une comparaison a posteriori. Dans le contrôle de la compétence, les patients infectés par des isolats résistants à la ciprofloxacine étaient plus susceptibles d’avoir une maladie sous-jacente que ceux infectés par la ciprofloxacine. OU ; % CI, –

Tableau View largeTélécharger slideCaractéristiques des patients infectés par Campylobacter jejuni résistants à la ciprofloxacine acquis localement View largeTélécharger slideCaractéristiques des patients infectés par Campylobacter jejuni résistants à la ciprofloxacine acquis localement Les personnes ayant contracté des infections à Campylobacter à l’étranger étaient plus susceptibles d’être infectées par des souches résistantes; % des isolats acquis à l’étranger étaient résistants à & gt; classe d’agent antimicrobien, comparé à% d’isolats acquis localement; % IC, – Les résistances à la ciprofloxacine et à la tétracycline étaient significativement plus fréquentes parmi les isolats acquis à l’étranger que parmi les isolats acquis localement: ciprofloxacine,% vs% OR,; % CI, -; et tétracycline,% vs% OR,; % CI, – Neuf patients avaient voyagé en Asie Indonésie, Malaisie, Singapour, Thaïlande et Vietnam au cours de la semaine précédant le début de la maladie; Les patients infectés par des souches localement résistantes à la ciprofloxacine n’étaient pas plus susceptibles d’avoir pris un agent antimicrobien au cours des semaines précédant le début du traitement que les patients infectés par des isolats sensibles à la ciprofloxacine% vs %; OU, ; % IC, – Aucun patient infecté par un isolat résistant à la ciprofloxacine n’avait pris de fluoroquinolone dans les semaines précédant l’apparition de la maladie. Neuf pour cent des patients résistants à la ciprofloxacine ont reçu une antibiothérapie pour leur infection à Campylobacter, comparé à% des patients sous ciprofloxacine- isolats sensibles; cependant, cette différence n’a pas atteint la signification statistique OU; % CI, -Infection avec une souche C jejuni résistante à la ciprofloxacine n’a pas entraîné de maladie plus grave, mais le nombre de patients infectés par une souche C jejuni résistante à la ciprofloxacine était faible. distribution des symptômes; Comparativement aux patients infectés par des souches sensibles à la ciprofloxacine, les patients infectés par des souches résistantes à la ciprofloxacine n’étaient pas plus susceptibles d’avoir de la fièvre% vs%; OU, ; % IC, – ou vomissements% vs%; OU, ; % CI, -, ou selles sanglantes% vs%; OU, ; % IC, – La durée de la diarrhée était similaire chez les patients infectés par des souches résistantes à la ciprofloxacine et chez les patients infectés par des souches sensibles à la ciprofloxacine, la durée médiane des deux groupes, jours; P =, tout comme le pourcentage de patients nécessitant une hospitalisation% vs%; OU, ; % IC, – et la durée médiane du séjour à l’hôpital pour les deux groupes, jours; P = dans les modèles multivariés contrôlant l’âge et la maladie sous-jacente, indépendamment de l’état de voyage

Discussion

d’isolats cliniques en Indonésie étaient résistants à la ciprofloxacine La source d’isolats résistants provenant d’infections contractées localement n’est pas claire Il est possible que le cas-patient ait été à l’étranger & gt; jours avant le début de la maladie ou a eu un contact direct avec un voyageur récemment retourné; cependant, la transmission de personne à personne est rare D’autres sources possibles comprennent la consommation d’aliments contaminés ou importés ou l’acquisition d’une résistance pendant un séjour à l’hôpital. Cependant, seuls les patients infectés par des isolats résistants à la ciprofloxacine ont été admis à l’hôpital. En outre, seuls les poulets cuits sont autorisés en Australie et il est peu probable que des organismes Campylobacter viables soient présents. Des études précédentes ont montré que le traitement des quinolones après le début de la maladie mais avant le prélèvement des selles est associé à la détection des quinolones. isolats résistants Nous n’avons pas recueilli d’information sur le moment du traitement antimicrobien ni sur l’agent utilisé. Cependant, les patients atteints d’isolats résistants à la ciprofloxacine étaient significativement plus susceptibles d’avoir reçu un traitement antibiotique pour leur infection que les patients infectés par des isolats sensibles et la ciprofloxacine est couramment utilisé en Australie pour le traitement ment des infections entériques Par conséquent, cette explication est plausible. Trois études australiennes antérieures ont rapporté des antécédents de voyage de patients examinés, et d’isolats, respectivement ; La taille des échantillons dans ces études peut avoir été insuffisante pour détecter une faible prévalence d’isolats résistants. Les raisons de la variation de la prévalence apparente d’isolats résistants à la ciprofloxacine acquis localement selon l’état de résidence ne sont pas claires et nécessitent des études plus approfondies.Résistance au sulfisoxazole, à l’ampicilline et à la roxithromycine La prévalence de la résistance à l’ampicilline dans cette étude% était similaire à celle rapportée dans des études australiennes antérieures et des études au Royaume-Uni De faibles niveaux de résistance ont été détectés pour l’érythromycine chloramphénicol, gentamicine et kanamycine, comme indiqué en Australie et ailleurs [,,,] La résistance à la tétracycline était faible, ce qui contraste avec les résultats des États-Unis mais est similaire aux résultats européens [,,] les cas associés au voyage étaient plus souvent résistants à l’acide nalidixique, à la ciprofloxacine et à la tétracycline Des isolats résistants à l’acide nalidixique et sensibles à la ciprofloxacine ont été trouvés parmi les isolats obtenus en voyage et acquis localement, comme on a pu le constater dans d’autres études Six pour cent les patients avaient pris un agent antimicrobien dans les semaines précédant le début de la maladie, mais il n’y avait aucune association entre cette résistance et la ciprofloxacine. Dans notre étude, l’infection par un isolat résistant à la ciprofloxacine n’était pas associée à une augmentation de la gravité de la maladie; ceci contraste avec une étude des États-Unis, dans laquelle un nombre similaire de patients infectés par des organismes résistants à la ciprofloxacine étaient plus susceptibles d’être hospitalisés et de présenter une diarrhée sanglante que les patients infectés par des isolats sensibles. avec des isolats résistants à la ciprofloxacine chez lesquels la diarrhée prolongée était incluse; Il est possible que la plus grande taille de l’échantillon augmente la puissance statistique de l’étude pour détecter une différence. Il y a quelques limites à la généralisation des résultats de cette étude à la population australienne. Les patients inclus dans cette étude ont été identifiés Deuxièmement, nous nous sommes appuyés sur des informations autodéclarées concernant les voyages outre-mer, la thérapie antimicrobienne et les symptômes cliniques, et cette information n’a pas été validée. Cependant, le biais de mesure potentiel résultant de cette En résumé, la résistance aux antimicrobiens chez les souches australiennes de C jejuni est rare, à l’exception de la résistance à l’ampicilline, à la roxithromycine et au sulfisoxazole. La résistance aux fluoroquinolones est particulièrement importante. faible et reflète probablement Austra L’utilisation rationnelle des fluoroquinolones dans le traitement clinique reste une priorité pour maintenir une faible prévalence de la résistance chez les C jejuni et chez les autres organismes. Les États-Unis ont retiré leur approbation pour l’utilisation de fluoroquinolones chez les animaux, à la suite de rapports entre et des niveaux croissants de résistance aux fluoroquinolones Une telle politique devrait être envisagée pour une adoption plus large La détection de la résistance à la ciprofloxacine parmi les infections acquises localement justifie des investigations supplémentaires et une surveillance continue

Groupe d’étude australien sur le sous-typage de Campylobacter

Centre médical Penny Adamson Flinders, Australie-Méridionale, Institut de pathologie clinique et de recherche médicale Kellie Cheung, Westmead, Nouvelle-Galles du Sud, Barry Combs Département des services humains, Adélaïde, Australie-Méridionale, Craig Dalton Hunter, Nouvelle-Galles du Sud , Steve Djordjevic Elizabeth Macarthur Institut agricole, Camden, Nouvelle-Galles du Sud, Robyn Doyle Institut des sciences médicales et vétérinaires, Adélaïde, Australie-Méridionale, John Ferguson Hunter New England Health Service, Newcastle, Nouvelle-Galles du Sud, Lyn Gilbert Institute of Clinical Pathology and Medical Recherche, Westmead, Nouvelle-Galles du Sud, Rod Givney Département des services humains, Adélaïde, Australie-Méridionale, Centre médical David Gordon Flinders, Bedford Park, Australie-Méridionale, Joy Gregory Département des services humains, Melbourne, Victoria, Unité de diagnostic microbiologique Geoff Hogg, Université de Melbourne, Parkville, Victoria, Division de microbiologie Tim Inglis & amp; Maladies Infectieuses, PathWest, Nedlands, Australie-Occidentale, Peter Jelfs Institut de pathologie clinique et de recherche médicale, Westmead, Nouvelle-Galles du Sud, Martyn Kirk OzFoodNet, Canberra, Territoire de la capitale australienne, Karin Lalor Département des services humains, Melbourne, Victoria, Jan Lanser Institute de pathologie clinique et de recherche médicale, Westmead, Nouvelle-Galles du Sud, Institut Lance Mickan des sciences médicales et vétérinaires, Adélaïde, Australie-Méridionale, Lyn O’Reilly Division of Microbiology & amp; Maladies infectieuses, PathWest, Nedlands, Australie occidentale, Unité de diagnostic microbiologique Rosa Rios, Parkville, Victoria, Département de santé Minda Sarna, Perth, Australie occidentale, Hemant Sharma Hunter Service de santé de la Nouvelle-Angleterre, Newcastle Nouvelle-Galles du Sud, Helen Smith Queensland , Coopers Plains, Queensland, Leanne Unicomb OzFoodNet, Santé de la population de Hunter New England et Centre national d’épidémiologie et de santé de la population, Australian National University, Canberra, Territoire de la capitale australienne et Mary Valcanis Unité de diagnostic microbiologique, Université de Melbourne, Parkville, Victoria

Remerciements

Soutien financier Le programme de travail OzFoodNet, une initiative du Département australien de la Santé et du Vieillissement du gouvernement australien et de New South Wales Health, par l’intermédiaire du Hunter Medical Research Institute Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: aucun conflit

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