Infection invasive à Saccharomyces: un examen complet

Contexte Saccharomyces cerevisiae, également connue sous le nom de «levure de boulanger» ou «levure de bière», est généralement considérée comme une commensale digestive occasionnelle. Cependant, depuis le début de cette étude, on a signalé de plus en plus de cas d’infection invasive. caractéristique de ces infections est leur association avec une préparation probiotique de Saccharomyces boulardii un sous-type de S cerevisiae pour le traitement divers troubles diarrhéiques Méthodes Nous avons recueilli des rapports de cas publiés, jusqu’à mai, de l’infection invasive Saccharomyces par l’utilisation d’une requête Medline tableaux épidémiologiques et cliniques et stratégies thérapeutiques Les facteurs prédisposants étaient similaires à ceux de la candidose invasive, le cathéter intravasculaire et l’antibiothérapie étant les plus fréquents. Le sang était le site d’isolement le plus fréquent chez les patients S boulardii représentait% des fongémies et était exclusivement isolé Par rapport aux patients infectés par S cerevisiae, les patients infectés par S boulardii étaient plus fréquemment immunocompétents et avaient un meilleur pronostic Saccharomyces infection invasive était cliniquement indiscernable d’une candidose invasive Dans l’ensemble, les isolats cliniques S cerevisiae présentaient une faible sensibilité à l’amphotéricine B et aux dérivés azolés , résultat global favorable dans% des cas Le traitement par amphotéricine B intraveineuse et fluconazole, en combinaison avec l’ablation du cathéter vasculaire central, ont été des options thérapeutiques efficaces. Les organismes Saccharomyces doivent maintenant être ajoutés à la liste croissante des pathogènes fongiques émergents. l’utilisation de préparations probiotiques S boulardii

Saccharomyces cerevisiae aussi connu comme « levure de boulanger » ou « levure de bière » est répandu dans la nature et peut être trouvé sur les plantes et les fruits et dans le sol S cerevisiae est maintenant inclus dans certains aliments diététiques ou de santé Saccharomyces boulardii, un sous-type de S cerevisiae , est également utilisé dans la préparation probiotique pour la prévention et le traitement de divers troubles diarrhéiques, tels que ceux associés à Clostridium difficile infection ou nutrition parentérale Sur la base des résultats d’études moléculaires, S boulardii est maintenant considéré comme un taxon invalide et doit être considéré comme un sous-type ou une variété de S cerevisiae Il n’est pas toujours possible d’identifier S boulardii, car ses caractéristiques auxotrophes phénotypiques ne sont pas pathognomoniques du sous-type Bien qu’une analyse enzymatique de restriction de l’ADN mitochondrial le caryotypage sont les tests les plus fréquemment utilisés pour identifier S boulardii, ces méthodes n’ont pas encore été complètement évaluées, notamment pour leur discriminateur Nous avons constaté que le séquençage des espaceurs transcrits internes n’a pas permis de discriminer S boulardii de certaines souches de S cerevisiae CH, données non publiées À notre connaissance, la détermination de la longueur d’un Le locus contenant des microsatellites, qui a été réalisé par Hennequin et al sur des souches de S cerevisiae et des isolats de S boulardii, est la seule méthode publiée permettant de distinguer de manière fiable S boulardii des autres souches de S cerevisiae.Le taux de portage des Saccharomyces varie selon les populations étudiées. Des études ont montré que les voies respiratoires de% des patients atteints d’une maladie pulmonaire chronique étaient colonisées par des organismes Saccharomyces Occasionnellement, S cerevisiae peut être isolé de la flore vaginale% -% des femmes , et S cerevisiae est considéré comme être responsable des symptômes imitant la vaginite à Candida dans% des cas Une étude plus récente impliquant des patients atteints d’hémato la maladie logique a rapporté l’isolement de S cerevisiae des échantillons de gorge, de selles, d’urine et de périnée en%,%,% et% des patients, respectivement On ne sait pas si S cerevisiae est une commensale persistante du tube digestif ou si Il est intéressant de noter que parmi les patients hospitalisés pour une greffe de moelle osseuse, S cerevisiae n’a été isolé qu’une seule fois, malgré des cultures de surveillance hebdomadaires principalement de prélèvements de selles et de prélèvements de gorge pendant l’hospitalisation [S] cerevisiae provenant de personnes atteintes de pathologies fongiques et considérées comme une cause d’infections fongiques invasives L’incidence de Saccharomyces fungemia variait de% dans une étude rétrospective des cas nosocomiaux de fongémie à% parmi les patients des hôpitaux universitaires français Parmi ces cas, il y a un nombre croissant d’observations concernant les infections invasives avec S boulardii Pour générer des hypothèses pour l’évaluation future de pr stratégies uniformes, nous avons effectué une revue complète des rapports publiés sur les infections invasives à Saccharomyces, en mettant l’accent sur les caractéristiques épidémiologiques et cliniques et les différences entre les infections invasives à S cerevisiae et S boulardii.

Matériaux et méthodes

Nous avons examiné les rapports publiés d’infection invasive à Saccharomyces trouvés dans la base de données Medline Les mots clés suivants ont été recherchés: « Saccharomyces », « épidémiologie », « invasive », « infection », « sepsie » et « fungemia ». Nous avons uniquement considéré une infection prouvée, basée sur les définitions du groupe coopératif des infections fongiques invasives du groupe d’étude de l’Organisation européenne pour la recherche et le traitement du cancer-mycose de la coopérative de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses. groupe : fongémie, isolement à partir de fluides normalement stériles, p. ex., pleuraux et synoviaux, et infections des sites profonds histologiquement prouvés pour les sites susceptibles d’être colonisés par les poumons, le péritoine et l’œsophage Nous n’avons pas inclus les patients asymptomatiques la cavité péritonéale après une perforation digestive ou une intervention chirurgicale, ou à partir d’urine, d’écouvillons buccaux, de selles ou d’urine vaginale. b), parce que ces patients étaient plus susceptibles d’avoir une colonisation plutôt qu’une véritable infection Les patients avec une information clinique insuffisante ont été exclus Nous avons considéré S boulardii comme agent étiologique si le patient recevait un traitement contenant un probiotique S boulardii et / ou si une méthode de typage moléculaire confirmait l’identification de ce pathogène Les données sur l’âge, le sexe, la maladie sous-jacente, l’état immunologique, l’antibiothérapie antérieure et l’utilisation du cathéter intraveineux ont été recueillies pour chaque cas. , une neutropénie profonde, un traitement immunosuppresseur ou le SIDA ont été rapportés néonatal. Une neutropénie profonde a été définie comme un nombre absolu de neutrophiles de & lt; × neutrophiles / L au moment de l’isolement de Saccharomyces L’antibiothérapie a été prise en compte comme facteur prédisposant éventuel au moins une semaine avant l’isolement des organismes Saccharomyces. Un traitement antifongique et un retrait du cathéter intraveineux ont également été enregistrés. le patient a survécu ou si l’infection a été guérie, par exemple, les résultats de culture après le traitement ont été négatifs Nous avons également étudié la sensibilité in vitro en examinant les études qui ont inclus & gt; isolats qui ont subi un test de sensibilité au moyen de composés disponibles dans le commerceAnalyse statistique Les valeurs sont moyennes ± écart-type sauf indication contraire Les comparaisons entre groupes ont été réalisées en utilisant le test exact de Fisher pour les variables continues et un test for pour les pourcentages P de & lt; ont été considérés comme statistiquement significatifs

Résultats

Dans une revue complète, nous avons trouvé des cas documentés d’infection invasive à Saccharomyces. Quinze cas ont été diagnostiqués auparavant et des cas ont été diagnostiqués après. L’âge des participants était de ± ans; le patient le plus jeune était âgé de plusieurs jours, et le patient le plus âgé était âgé de ans. Le rapport de masculinité était féminin et masculin. Les patients avec S cerevisiae fungemia étaient significativement plus jeunes, ± contre ± ans; P & lt; et plus susceptible d’être le ratio de sexe féminin, vs; P & lt; que les patients ayant une infection localisée, c’est-à-dire un seul organe

Tableau View largeTélécharger la lame Caractéristiques cliniques et microbiologiques des patients atteints d’infections invasives à Saccharomyces cerevisiaeTable View largeTélécharger DiapositiveClinical and microbiologic features of patients with Saccharomyces cerevisiae infections invasives

Tableau View largeTélécharger la lameClinical and microbiologic features of patients with Saccharomyces boulardii fungemiaTable View largeTélécharger slideClinical et microbiologic caractéristiques des patients atteints de Saccharomyces boulardii fungemiaLes conditions sous-jacentes Tous les patients avaient au moins la condition facilitant le développement d’infections fongiques invasives Utilisation de cathéter intraveineuse par les patients et reçu antérieurement l’antibiothérapie par les patients ont été les tables de facteurs de prédisposition les plus fréquemment rapportés et S boulardii a été considéré comme l’agent étiologique dans les cas L’identification moléculaire a été réalisée dans les cas, principalement par l’analyse de restriction-enzyme de l’ADN mitochondrial n’a pas pris de probiotique contenant S boulardii au moment du diagnostic. Comparés aux patients infectés par S cerevisiae, les patients infectés par S boulardii étaient plus susceptibles d’avoir une maladie du tube digestif% vs%; P & lt; , avoir un cathéter intraveineux% vs%; P & lt; et être hospitalisé dans une unité de soins intensifs% vs%; P & lt; En revanche, la fréquence de l’immunodépression était plus faible chez les patients infectés par S boulardii que chez les patients infectés par S cerevisiae% vs%; P & lt; Les sujets Saccharomyces étaient le plus souvent isolés de patients sanguins, soit exclusivement des patients, soit avec d’autres organes. S boulardii était exclusivement isolé du sang n = isolement concomitant de S cerevisiae et un second microorganisme, principalement des entérobactéries, a été rapporté dans les cas de fungemia Le patient a reçu un diagnostic post-mortem d’infection disséminée, bien que les résultats positifs d’hémoculture n’aient pas été enregistrés avant la mort. Dans les cas restants, l’infection était localisée à un seul organe globalement les poumons pour les patients et les valvules cardiaques pour les patients. Parmi ces patients, un traitement antifongique a été administré par voie intraveineuse à l’amphotéricine B seule ou en association avec d’autres patients. Le fluconazole a été le traitement de première intention le plus fréquemment administré lors de l’isolement de S cerevisiae. étaient r traitement antifongique en cours de traitement: recevaient un traitement prophylactique par le fluconazole et recevaient un traitement curatif par le kétoconazole ou l’itraconazole Des patients pour lesquels l’action sur le cathéter avait été signalée avaient été retirés du cathéter. l’infection à boulardii avait un meilleur pronostic que les patients avec une infection à S cerevisiae% vs%; P & lt; Les taux de résultats favorables chez les patients immunodéprimés% et les patients immunocompétents% ne diffèrent pas significativement Il n’y avait pas de différence significative dans les taux de résultats favorables entre les patients traités par amphotéricine B intraveineuse et les patients traités par fluconazole% Résultats des tests de sensibilité in vitro études dans lesquelles & gt; isolats ont subi des tests de sensibilité antifongique Les résultats sont reportés dans le tableau

Vue de table grandDownload slideSaccharomyces cerevisiae susceptibilités antifongiques dans les études dans lesquelles & gt; les isolats ont été testésTable View largeTélécharger la lameSaccharomyces cerevisiae des susceptibilités antifongiques dans des études dans lesquelles & gt; les isolats ont été testés

Discussion

exsudats jaunes et plaques jaunes-blanches de l’œsophagite sur fond érythémateux sont présentes dans les deux cas, voire indiscernables des infections dues à d’autres microorganismes, comme l’endocardite. De plus, les patients présentent des symptômes non spécifiques pouvant être liés à la maladie sous-jacente. Le diagnostic d’infection à Saccharomyces est souvent inattendu La fièvre, lorsqu’elle est notée, est présente chez% des patients Cependant, l’impact clinique de l’infection à Saccharomyces a été clairement évalué chez un patient immunocompétent dont le facteur prédisposant unique était l’ingestion d’aliments santé contenant des levures viables. Le patient s’est rétabli quand il a cessé d’ingérer des aliments de santé contenant des levures. La présence de l’implication du site profond avec la documentation histologique souligne également la pathogénicité de ces levures. ces cas, les levures étaient le plus souvent le cul Les particularités significatives des infections à S boulardii comprennent une fréquence plus élevée d’hospitalisation en unité de soins intensifs, la présence d’un cathéter à demeure et une maladie intestinale. Cela peut correspondre à des facteurs prédisposants spécifiques ou, plus probablement, refléter des conditions associé à un traitement avec un probiotique contenant S boulardii, comme une maladie digestive sévère Le manque d’atteinte des organes et le meilleur pronostic pourraient être dus à une diminution de la virulence S boulardii Une autre explication pourrait être la capacité des patients à risque de contrôler partiellement l’infection, étant donné S boulardii a montré un niveau intermédiaire de virulence dans un modèle murin expérimental d’infection invasive impliquant à la fois des souris immunocompétentes et immunodéprimées S cerevisiae a, chez des souris immunodéprimées, montré se développer en ° C et former des pseudohyphae Aussi, SSD, qui code une protéine qui affecte cts différents processus cellulaires, y compris le maintien de l’intégrité cellulaire, le contrôle du cycle cellulaire et la croissance à haute température, semble jouer un rôle important dans la virulence des organismes Saccharomyces La suppression de ce gène entraîne une augmentation significative de la virulence. Les altérations de la composition et de l’architecture des parois cellulaires sont supposées conduire à une surstimulation de la réponse pro-inflammatoire En outre, l’analyse des souches sauvages et cliniques de S cerevisiae a montré une virulence similaire dans un modèle murin de souris. infection Similaire à beaucoup d’organismes opportunistes, il n’est pas possible d’identifier les caractéristiques particulières de S cerevisiae qui distinguent les souches environnementales et cliniques sur la base du phénotype de virulence S cerevisiae présente une faible sensibilité à l’amphotéricine B et aux dérivés azolés Bien que les points de rupture n’aient pas été définis pour S cerevisiae, la CMI pour le fluconazole et on considère que l’itraconazole se situe dans la plage dose-dépendante sensible définie pour le C. albicans On peut supposer que ces médicaments peuvent jouer un rôle dans l’émergence de S cerevisiae Bien que les données restent rares, le voriconazole semble présenter une bonne efficacité contre S cerevisiae, avec un MIC de & lt; La publication récente de mg / LA rapporte des résultats positifs avec un traitement par le voriconazole chez un patient atteint de S boulardii qui n’a pas répondu au traitement initial par le fluconazole Aucune série publiée n’est disponible pour le traitement à la caspofungine, mais une étude préliminaire a montré une efficacité limitée. de souches CH, données non publiées Les valeurs MIC pour l’amphotéricine B et le fluconazole étaient respectivement mg ​​/ L, comme déterminé pour les isolats cliniques de S boulardii S boulardii n’a pas pu être testé par Etest AB Biodisk sur casitone ou agar de Roswell Park Memorial Institute de l’absence de croissance sur ces milieux AE-A et CH, données non publiées Malgré ce spectre de susceptibilité, un résultat favorable a été observé en% des cas révélés dans notre recherche documentaire, un pourcentage légèrement supérieur à celui rapporté pour les candidoses invasives Les données spécifiques sur la morbidité étaient difficiles à évaluer, car les infections à Saccharomyces grand nombre de comorbidités L’utilisation de l’amphotéricine B ou du fluconazole avec un cathéter veineux central semble être une option thérapeutique efficace pour les patients infectés par Saccharomyces. Un résultat favorable peut aussi être lié à la faible virulence de cette espèce, hypothèse soutenue par l’absence En conclusion, les organismes Saccharomyces sont de plus en plus souvent signalés en tant qu’agents d’infection invasive, en particulier chez les patients immunocompromis ou gravement malades. Les préparations probiotiques S boulardii, qui représentent près de% des cas d’infection, doivent faire l’objet d’une attention particulière.

Remerciements

Nous remercions les membres de l’Unité de Génétique Moléculaire des Levures de l’Institut Pasteur de Paris; nos membres du laboratoire, pour des discussions fructueuses; et Dr Denis Angoulvant INSERM E Université Cl Bernard Lyon et Cécile Fairhead Paris Institut Pasteur, pour leurs lectures et conseils utiles Conflits d’intérêts potentiels AA-E et CH: no conflict

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